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　先日、特別口座（源泉徴収あり）のＬＶＧＯから、一般口座に出庫したＴＤＯＣを売却しました。　　　　　　　　　　　　　　　　
ふと、確定申告について疑問に思ったため、楽天証券に問い合わせたところ、一般口座と特別口座で重複して取引した場合、通算損益で確定申告が必要とのことでした。　　
　
特別口座は既に源泉徴収されているので、一般口座のみ確定申告ということにはできないものでしょうか？（住民税等で不利になると思われるので）　　　　
　　　　　　
もし、ご存知の方いらっしゃいましたら、ご教示いただけますでしょうか。

どなたかご存知の方教えてください。
昨日、楽天証券でリヴォンゴから切り替わったテラドック20株を売却したところ、資産額が30万ほど目減りしてしまいました。
ほかの株でも多少上下はありましたが、30万も減額するほどの下げではありませんでした。
吸収合併された株を売却する場合、このようなケースはあるのでしょうか？